名侦探柯南剧场版14天空的遇难船

园子的叔叔铃木次郎吉因不甘于接受失败而再度向活跃于全世界，恶名昭彰的宝石怪盗基德激起了大挑战：具有“天空的贵妇人”美名之称的宝石就放置于世界最大的飞行船——贝尔•雪利二世号之中，能偷的话就来偷偷看，时间限制为东京到大阪六小时的飞程。
关于这场大挑战的世纪大新闻，媒体记者自然不会轻易放过，不惜兴师动众前往飞船一探究竟，而柯南、小兰等人作为园子的朋友自然也在受邀之人的行列。当众人都屏着呼吸在等待着这六个钟头大富豪与怪盗基德挑战的最终结果时，却不知另一波危险正在悄悄的来临……不知因何故，恐怖组织红色暹罗猫也盯上了这艘飞船。前不久，这伙可怕的犯罪分子才袭击了国立东京微生物研究所，并盗走了一种致命的病毒。那么，此番飞船之上的挑战究竟哪里吸引了他们的眼球？怪盗基德会前来迎战吗？当恐怖组织、怪盗基德都登上这艘飞船之时，船上又将发生什么令人想不到的事件？